合成生物工程实训车间是学院立足生物技术产业前沿，打造的集实践教学、技术研发、技能竞赛与职业认证培训于一体的现代化实训平台，旨在培养掌握合成生物学工程技术的高素质复合型人才。车间位于实训基地3楼，下设基因编辑操作区、微生物发酵实训区及产物纯化分析区三大功能模块，构建覆盖合成生物技术“设计－构建－测试－应用”全链条的沉浸式实训体系。

‌基因编辑操作区‌以“理论－设计－实践”一体化模式为核心，整合CRISPR-Cas9等基因编辑技术理论教学与分子克隆实操训练空间，可开展基因序列设计、载体构建、细胞转染与基因功能验证等标准化实训项目，助力学生在“学中做、做中学”中掌握精准基因操作技能。

‌微生物发酵实训区模拟工业发酵车间场景，配备了带自动控制的发酵罐、能实时显示数据的监测系统及产物检测等仪器设备。‌该区域聚焦菌种选育、发酵工艺优化、代谢产物调控及发酵过程故障诊断等核心技能训练，旨在培养具备扎实工业发酵实践能力的应用型人才。

‌产物纯化分析区‌集成层析系统、离心分离设备及高效液相色谱仪等先进仪器，可开展蛋白纯化、产物检测、质量分析及工艺优化等实训项目，强化学生从实验室研发到产业化生产的全链条实践能力。