金华市化工与制药高新技术研究开发中心，以金华市重点学科《环境工程与科学》，学校重点学科《化学工程》和校级创新团队《生物与化学催化技术创新团队》为建设基础，开展化工与制药领域的研究，重点研究高附加值化学品合成、药物制剂以及新型催化材料等。

金华市动物用药科学技术研究开发中心，由学校与浙江耐司康药业有限公司联合建设，重点开展动物用药新技术与新剂型、中药在动物疾病中的应用等研究。研发中心完成的产业化项目包括阿莫西林可溶性粉（80%）、硫酸头孢喹肟注射液（混悬型）和肠炎宁口服液等。

金华市新型材料科学技术研究开发中心，致力于在医用材料、稀土材料以及新型建筑材料等多个领域开展前沿技术研究。在医用材料方面，重点开展纳米级微粒负载对药物的可控释放应用研究以及纳米药用材料的合成路径优化；在稀土材料方面，重点开展掺杂稀土的新材料研究；在新型建筑材料方面，重点开展具有特定功能的新型建筑材料开发与应用研究。